公路：连接区内外的高等级的公路惠（州）澳（头）疏港大道可与深汕高速、惠盐高速、广汕高速和在建的广惠高速、惠河高速等干线道路联通；正在筹建的澳（头）深（圳）沿海一级公路建成后，开发区至深圳特区的距离仅为36公里。区内高标准的城市道路交通网络已基本完善，可以适应发展的需要。

    铁路：京九铁路和广梅汕铁路横贯惠州，由惠澳铁路连接惠州港，惠澳铁路从惠州站接轨，经惠环、三栋、永湖、淡水至大亚湾澳头（惠州港），线路长度为51公里，路轨已全线铺通，2003年底可建成通车。

    航空：开发区北距惠州平潭机场36公里，西至深圳宝安机场70公里，均在1个小时东程内。

    海运：区内的惠州港是国家一类对外口岸，可以直航世界各大港口，目前已建成1至15万吨级码头泊位5个，5千吨级以下泊位13个，年吞吐能力达1600万吨，库区储存能力80万立方米。并开通了至香港的客运航班。